Après 3 ans passés en Guadeloupe, Jean-François Carenco a été nommé préfet de Haute-Savoie. Il est remplacé par Dominique Vian, ancien secrétaire général de la préfecture de Guadeloupe, et ex-préfet de Guyane.Dominique Vian, 57 ans, connaît bien la Guadeloupe pour y avoir exercé les fonctions de secrétaire général de la préfecture. Par la suite, il a été promu préfet de Guyane où il a eu à gérer les émeutes des étudiants guyanais qui réclamaient un rectorat de plein exercice. Dominique Vian sera nommé ensuite préfet de l’Ardèche.
Le nouveau préfet de Guadeloupe est réputé être un homme à poigne et intransigeant. Voilà qui promet dans un pays qui se caractérise par des grèves à répétition et des négociations souvent tendues entre patronat et syndicats.
A 50 ans, Jean-François Carenco est lui nommé préfet de Haute-Savoie. En poste dans le Tarn-et-Garonne pendant près de 2 ans, il sera donc resté 3 ans en Guadeloupe. A son arrivée en juillet 1999, il est apparu comme un homme de dialogue, débarquant en pleine offensive de l’UGTG dans le délicat dossier des personnels communaux.
Par la suite, les relations entre la direction du syndicat et le représentant de l’Etat allaient considérablement se dégrader, notamment depuis l’affaire Madassamy et le saccage des magasins pointois le 27 mai 2001, jour de commémoration de l’abolition de l’esclavage.
Outre les dossiers liés aux conflits sociaux, Jean-François Carenco aura eu à gérer l’affaire de la Boucan et la pollution de l’usine Bonne-Mère, à Sainte-Rose, ou encore le feuilleton des transports en commun. Il s’est aussi distinguer dans les dossiers économiques, notamment la Loom, la loi d’orientation pour l’outre-mer, mise en place par le gouvernement Jospin.
Jean-François Carenco connaît bien l’outre-mer pour avoir notamment occupé les fonctions de secrétaire général adjoint pour les affaires économiques en Nouvelle-Calédonie en 1988, puis secrétaire général de Nouvelle-Calédonie de 1990 à 1991, et préfet de la collectivité territoriale de Saint-Pierre-et-Miquelon entre 1996 et 1997.